Tezli Yüksek Lisans ve Doktora Programlarına kayıtlı normal öğrenim süresi içerisindeki öğrenciler için; 2012/3584 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı ile I. Öğretim harçları kaldırılmış olup, Bilgi Yönetim Sistemi (http://bys.ibu.edu.tr/ ) üzerinden DERSE KAYITLANMA (Ders/Tez/Uzmanlık Alan Dersi) işlemlerini yapmaları gerekmektedir.
• Bakanlar Kurulu Kararının Madde 11/3’de göre “Bir yükseköğretim programına (lisans veyaz tezsiz yüksek lisans) kayıtlı iken ikinci bir yükseköğretim programına (çift ana dal programları hariç olmak üzere) kayıt yaptırmaları halinde ikinci yükseköğretim programına ait öğrenci katkı payları, öğrencilerin kendileri tarafından karşılanır.”
• Tezli Yüksek Lisans ve Doktora Programlarına kayıtlı normal öğrenim süresini tamamlayan öğrencilerin (Yüksek Lisans 5. ve sonrası dönemler, Doktora için 9. ve sonrası dönemler); 2547 sayılı Kanunun 44. ve 46. madde hükümleri ile Bakanlar Kurulunca belirlenen esaslara göre Üniversitemizce belirlenen tutarı ödemeleri gerekmektedir.
• Öğrenciler öğrenim ücreti ödemelerini Türkiye İş Bankası aracılığı (yurt içindeki her hangi bir şubesi, bankamatikler, internet şubesi, telefon şubesi) ile öğrenci numaralarını beyan ederek ödeme yapabilirler.
Öğrenim ücretlerine ilişkin olarak 2547 sayılı Kanunun 44. ve 46. madde hükümleri ile Bakanlar Kurulunca belirlenen esaslara göre tezsiz yüksek lisans öğrencileri için program bazında ücret belirlenmekte ve ders kayıtları esnasında duyurulmaktadır.
Yükseköğretim Kurulu (YÖK) Başkanlığı, Lisansüstü Eğitim ve Öğretim Yönetmeliği'nde yapılan değişik nedeni ile 2019-2020 eğitim-öğretim bahar yarıyılı itibariyle yüksek lisans, doktora ya da sanatta yeterlik programına kayıtlı olmayanlar özel öğrenciliğe kabul edilmemektedir.
Yabancı öğrenciler Üniversite tarafından belirlenen karara göre öğrenim ücreti öderler. Bu ücret, yılda bir kez cari hizmet tablosuna göre düzenlenmektedir
Güz ve bahar yarıyılları başında ve akademik takvimde belirtilen tarihlerde; tezli veya tezsiz ikinci öğretim programlarında kayıtlı öğrenciler ikinci öğretim ücretini, uzaktan öğretim programında kayıtlı öğrenciler Üniversite tarafından belirlenen ders ücretini, tezli yüksek lisans ve doktora / sanatta yeterlik programlarında kayıtlı öğrenciler normal sürelerini aşmaları halinde katkı payını, yabancı uyruklu öğrenciler ise kayıtlı oldukları tezli / tezsiz yüksek lisans, doktora / sanatta yeterlik ya da uzaktan öğretim programlarına ait senato tarafından belirlenen ücretleri ödemek ve enstitü müdürlüğünce istenen kayıt yenileme işlemlerini yerine getirmekle yükümlüdürler.