Uluslararası öğrenciler yüksek lisans ve doktora programlarına yıl boyunca başvuru yapabilirler. Eğitim-Öğretim dönemi başladıktan sonra yapılacak başvurular bir sonraki eğitim-öğretim dönemi için değerlendirmeye alınır.
Lisansüstü Eğitim Enstitüsünün web sayfasında (http://lisansustu.ibu.edu.tr) uluslararası öğrenci başvuru arayüzüne erişim linki bulunmaktadır. Online alınan başvurularda adaylar diploma, transkript, pasaport ve resimlerini yükleyerek ve başvuru formunu doldurarak başvurularını yapabilirler. Başvurular ilgili Anabilim Dalı başkanlığı tarafından değerlendirildikten sonra Enstitü tarafından karara bağlanır ve adaya başvuruda kullandıkları e-posta yoluyla bildirilir.
Lisansüstü programlarda uluslararası öğrenciler için kontenjan sınırlaması yoktur. Başvurular ilgili Anabilim tarafından adayların lisans diploma ve transkriptlerine ve araştırma yapmak istedikleri alanlar göz önüne alınarak değerlendirilmektedir.